制造中心是口袋奇兵中提升战力的核心建筑之一，其功能包括修理战损士兵、生产新兵种以及研发强化部件。制造中心分为修理工厂、兵营和强化部件研究室三个部分。修理工厂负责修复防御战中受损的士兵，且不会导致士兵降级；兵营用于生产陆军、海军和空军单位，不同兵种占用格子数量不同；强化部件研究室则提供战斗属性加成的技能研发，直接影响部队的攻防能力。
修理工厂的机制明确区分了防御战和主动攻击的士兵处理方式。防御战中失败的士兵可进入修理工厂修复，且不会降级；而主动攻击阵亡的士兵无法修复，仅能通过重新生产补充。兵营的生产规则显示，陆军占1格，海军占6格，空军占4格，玩家需根据战场需求合理分配空间。船坞、机场和车库可通过道具扩展容量，部分装饰皮肤也能提供额外位置。这些设定要求玩家在资源有限的情况下优化兵种配置。
强化部件研究室提供的技能研发是制造中心的核心功能。根据战斗场景不同，玩家可研制两套强化方案：打架搭配推荐高速开火、武器强化、伤害加深、伤害减免和装甲强化；打BOSS搭配则侧重高速开火、武器强化、伤害加深、准具强化和暴击伤害。5级武器强化能提升90%攻击力，相当于5星英雄贝塞尔的加成效果，但成本仅为540钻石，性价比显著高于英雄培养。强化部件的通用性使其成为长期投资重点。
研究中心的特殊属性研究进一步扩展了制造中心的功能。该模块通过海岛商店获取材料，分为基础研究和进阶研究两部分。基础研究提升生命值和元素攻击，进阶研究则赋予兵种元素特效，如陆军穿透、海军电浆和空军爆炸。老区玩家可利用海岛商店两天兑换三次材料的机制加速研究，而新区每日仅能兑换一次。元素加成的选择需结合玩家当前属性强度，通常建议低战力玩家优先陆军攻击和海军生命加成。
